Намира се на около 580 м над морското равнище. самото селище е разположено в подковообразна котловина, формирана от сливането на долинните разширения на реките Белица и Райковска, притоци на Янтра. Дъгата на подковата е извита на север, а отворът и сочи на юг. Между двете разклонения се издига Бойчовския баир, който се простира на юг към Белнов връх, разположен непосредствено до главното било на Стара планина. По левия склон(източния) на котловината тече река Райковска. По нето минава пътят за Нова и Стара Загора, който през Предела(най-високата част на прохода) навлиза в Южна България. По десния(западния) дял от котловината тече река Белица от югозападна посока. По него мина пътят за Трявна и Габрово. Всичко това придава живописен вид на котловината гледана от северните възвишения Чардачето и Гърневския баир.
На юг се очертава главното било на стара планина с Предела и Грамадлива. На северозапад малката живописна котловина се загражда от височината Чукара, а на север – от възвишението на Гърневски баир и Чардачето. Те я предпазват от силните северозападни и северни ветрове през зимата. На изток котловината се загражда от Равната, Дряновски рът и Дойновския баир. Между Дряновски ръд и Дойновскя баир минава река Осенска, която се влива в река Райковска. Дойновскя баир се издига на югоизток към Дрянов връх, разположен в близост до предела. В центъра на описания район, гледан от север, се издига Бойческия баир разположен между реките Белица и Райковска.
Вонеща вода е китно балканско селище с хълмист терен, обрасъл с дъбови, букови и габърови гори. Съществуват и млади иглолистни гори. Почвите са сиви горски-песъчливи. Скалните масиви по височините са от пясъчник, базалт и варовик. Има много полянки, огрени от слънцето, покрити с горски цветя и обрасли с буйна трева. Поречията на реките Белица и Райковска образуват красива подковообразна котловина, заградена с високи хълмове, които я предпазват от ветровете и бурите. Често духа южният вятър. Самата котловина е открита на юг към Предела, през който, особено през зимата , се чувства топлото южно влияние.
Климатът на Вонеща Вода се характеризира с топло, но не горещо лято, сравнително мека зима и много слънчеви дни без мъгли. Въздухът е чист, свеж и сух. Ветровете са умерени, бури почти няма. През зимата и ранната пролет често духа южен вятър. Лятно време, особено вечер, по поречията на реките Белица и Райковска се появяват така наречените планински долинни ветрове, които са с малка скорост и подобно на морския бриз създават прохлада. Валежите през годината са умерени по количество-около 650-750 мм/м2 годишно. Преобладават валежите през месеците май, Юни и Септември. Слънчевите дни са средно 200-220 годишно със сумарна слънчева радиация около 365 калории на квадратен сантиметър средно дневно. Средната годишна температура е 9.5 градуса. Средната най-ниска температура през януари е около -1.5 градуса, а най-високата средна температура е около 20 градуса. Мъгли през годината почти не падат. Снежната покривка се задържа около 35-40 дни. Влажността на въздуха е умерена.